包括神经专科门诊兼癫痫中心（每周7个半天）、神经专家门诊（每周6个半天）、特需专家门诊（每周3个半天）、神经专科病房。我院专科门诊与专科病人日益增多，主要诊治小儿神经系统常见病、多发病及疑难病，特别是对癫痫发作的控制率可达80%以上。本院具备脑电图包括常规脑电图（有纸和无纸）、动态脑电图和视屏脑电图、脑血流图、脑地形图、CT及TDX的药物血浓度监测手段，使临床诊断、治疗水平居国内领先。与中山、华山医院合作开展影像学检查如CT、MRI、MRA、DSA、螺旋CT；TCD进行抗癫痫药物血浓度监测。较早开展新型抗癫痫药物的在儿童临床应用（丙戊酸钠、拉莫三嗪、托吡酯）；国内首先应用泰必利治疗小儿多发性抽动；低分子肝素在急性偏瘫综合征临床应用等。

      目前着手于惊厥性脑损伤的诊断与保护实验与临床研究、重症肌无力免疫特点研究、神经分子遗传等方面研究。神经专业从1979-2004共在全国核心期刊上发表150余篇论文，其中中华系列杂志20余篇，国外杂志发表3篇。其中十余篇文章对全国小儿神经学发展都有推动作用。主要著作有：孙道开教授主编《儿科多选题》、《癫痫病问答》，参编《现代儿科学》、《实用临床儿科学》、《儿童少年精神医学》、《小儿神经系统疾病基础与临床》、《临床癫痫学》及《儿科学》等20余部专著；周水珍教授参编《儿科学高级教程》、《现代儿科学》、《临床儿科学》、《实用儿科药物手册》、《临床袖珍手册-儿科》等多本专著；王艺副教授参编《循证医学》、《临床儿科手册》、《现代儿科学》3本专著。另外，发表科普文章100余篇。另定期举办全国神经新进展继续教育学习班。从八十年代起我院代表参加全国第一届及以后历届儿科神经专业会议；第一届、第二届全国脑电图电生理学会议；九十年代年后从第一届起及以后历届华东地区小儿神经学术会议；全国及上海儿科学术会议；以及参加国际学术交流如第23届国际癫痫会议（布拉格）、欧洲癫痫会议（华沙）、澳大利亚癫痫会议、国际小儿神经学术会议及国际神经病毒会议（美国）等。